秘传机器是推进剧情和探索地图的关键道具，共有8种不同功能的秘传技能需要获取。这些机器主要通过剧情推进或特定NPC赠送获得，无法在商店购买，且每台机器对应着不同的地图解锁能力。居合斩作为第一个获得的秘传机器，位于枯叶市道馆旁，需要砍断树木才能进入道馆。
野生原野区深处藏有两台重要机器：冲浪术在最深处屋子里的人处获得，而劲力则需要先在原野区内找到金牙，将其交给园长后才能换取。闪光术的获取条件较为特殊，需要玩家先掌握一字斩且收集10个图鉴后，在地鼠洞穴出口附近的屋内由博士助手赠送。
飞空术的获取地点在彩虹市，与左边卡比兽附近屋子里的女性NPC对话即可获得。碎岩术位于一岛的温泉洞穴内，由一位白胡子老人赠送。鱼跃龙门则需要前往四岛的阴森洞穴探索获得。潜水作为特殊秘传机器，在原版游戏中无法正常获取，仅能通过特殊方式获得，其功能在后续版本中被其他机制替代。
秘传机器的使用受徽章限制，部分技能需要对应道馆徽章才能在对战外使用。所有秘传技能都只能通过遗忘老人来替换，无法自然遗忘。这些机器在对战中同样能发挥战斗效果，并非仅限于地图互动功能。获取秘传机器的过程往往与主线剧情紧密关联，建议玩家在推进故事时留意NPC对话提示。部分机器需要完成前置任务才能触发获取条件，如野生原野区的金牙任务。
