少年三国志2神兽攻打入口在主界面下方“征战”模块内的“神兽秘境”，角色达到70级可开启讨伐玩法，分为本服与跨服两类神兽可挑战。
先解锁神兽秘境基础关卡才能开启对应神兽讨伐。秘境入口在征战界面，过关斩将玩法之后，图标为岛屿样式。秘境共20层关卡，每日可挑战一关，每5层设守关神兽BOSS，通关指定层数解锁对应讨伐神兽：巨猿默认开放，猞猁需通关10层，机关鸟需15层，机关牛需20层。每关含仙人试炼与秘境挑战任务，完成可获兽魂、兽灵丹等养成资源，守关BOSS每日仅可击杀一次。
神兽讨伐分本服与跨服两种，入口均在神兽秘境界面。本服神兽每日刷新，含巨猿、猞猁、机关鸟、机关牛四种，品质依次提升，最多6名玩家同时挑战，可互相竞争排名，伤害越高奖励越好，最终击杀有额外加成。跨服神兽含百战神兽与至尊神兽，每周固定时段开启，战区范围争夺，难度更高，至尊神兽需抢占归属位才能造成伤害，击败归属玩家可夺取权限，奖励更丰厚。
攻打神兽需把握战斗机制与阵容搭配要点。神兽有专属技能与行动条，需用控制武将打断爆发，搭配输出与治疗维持续航。站位上主坦放1号位承伤，核心输出避技能覆盖区放后排，合击选控场或爆发类，首回合快速释放压低血线。不同阵营适配不同神兽，蜀国选青龙、白虎提爆发，吴国靠朱雀灼烧，群雄搭配青龙强化输出。
神兽攻打奖励丰厚，是养成核心资源来源。讨伐可获神兽碎片、元宝、兽魂及装备箱，高阶红色装备能大幅提升战力。兽魂可在商店兑换碎片与养成材料，优先投入主力神兽升星进阶。完成秘境每日任务与讨伐排名奖励，还能积累图鉴进度，解锁全体属性加成，长期坚持可显著提升整体战力。
