遗迹山谷位于六之岛南部区域，其石门开启方式需要掌握特定技能。首先确保队伍中有宝可梦已学会居合斩，这是开启遗迹山谷石门的必备条件。该技能可通过圣安奴号船长获得，若尚未获取需先完成枯叶市相关剧情。携带会居合斩的宝可梦靠近石门直接使用技能即可开启，这是游戏设定的固定交互逻辑。
前往遗迹山谷前需完成系列前置任务。通关精灵联盟并击败四大天王后，前往一号岛宝可梦研究中心找橙博士升级图鉴获得彩虹票，这是解锁4-7岛通行权限的关键道具。通过枯叶市码头乘船抵达六之岛，沿南部水道使用冲浪术移动，经过绿色小径和森林地带后即可到达遗迹山谷入口区域。此处地形复杂，建议提前准备解毒药和复活药应对野生宝可梦。
石门开启后内部为多层洞穴结构，需按照特定路线探索。洞穴内分布着未知图腾和隐藏道具，部分区域需要推动岩石解谜，建议提前让宝可梦学习劲力技能。主要路线遵循上、左、右、下的基础顺序，在终点处可触发蓝宝石获取剧情。该区域存在被火箭队抢夺宝石的强制剧情战，需确保队伍保持足够战斗力。
完成遗迹山谷探索对游戏进程有重要影响。获取的蓝宝石需带回一号岛交给博士修理机器，此举将解锁七岛区域并开通两个地区的通讯功能。该区域还关联着超梦捕捉剧情，建议在探索过程中同步收集未知图腾以完善图鉴。遗迹山谷作为二周目核心区域，其解谜设计体现了游戏关卡与剧情推进的紧密关联性。
