口袋妖怪火红遗迹山谷的门需先解锁七岛剧情、抵达六岛并触发小茂对话，再用间合斩砍树开路，最后在洞穴门口使用间合斩开启石门。
开启遗迹山谷之门的核心前置是完成二周目关键剧情。先拿到船票解锁七岛航线，完成灯火山红宝石剧情并将宝石交给博士，触发七岛主线。随后乘船抵达六之岛，在岛上宝可梦中心与小茂对话，触发前往遗迹山谷的剧情线索，这是开启入口的关键触发条件。对话结束后，从宝可梦中心向右行进，沿水之步道向南，途中会遇到树木阻挡道路，此时需使用秘传技能间合斩砍断树木，开辟通往遗迹山谷的通道。
进入遗迹山谷后，沿杂草丛生的路径往中央行进，找到山谷核心的点之穴（洞穴），其入口石门紧闭。此时需再次使用间合斩对准石门，即可开启这扇关键之门，这是进入洞穴的唯一方式。进入洞穴前，建议备好闪光、劲力等秘传技能，洞穴内为多层迷宫，光线昏暗且有岩石机关，闪光可照亮道路，劲力能推动石块解谜，避免迷路或卡关。
进入点之穴后，需按固定路线穿越迷宫：依次向上、向左、向右、向下行进，直达洞穴底层。底层中央石室藏有关键道具蓝宝石，靠近后会触发火箭队研究员抢夺剧情，对方逃离时会留下火箭队仓库密码，此密码是后续解锁五之岛火箭队仓库的关键。迷宫部分分支路径藏有隐藏道具与野生宝可梦，如日之石、未知图腾等，可借助劲力推动石块开启隐藏通道，顺路收集资源提升探索收益。
完成遗迹山谷核心探索后，牢记密码并返回五之岛，进入火箭队仓库输入密码开门，击败研究员夺回蓝宝石。将蓝宝石与红宝石一同交给博士，可解锁全国图鉴的完整功能与宝可梦通讯权限。后续重返遗迹山谷，可重复探索洞穴刷取野生宝可梦，或收集剩余隐藏道具，为图鉴收集与阵容养成提供助力。
